Die Heidenlöcher befinden sich am Fuß einer senkrechten Felswand aus Molasse-Sandstein, wo diese in einen bewaldeten Hang übergeht. Vom Tal, wie auch von der Höhe des Heidenbühls, wo sich ein Wanderparkplatz befindet, führt ein Fußweg zu der Steilwand und zu den Höhlen.

Der südliche Teil der Anlage besteht aus einem schmalen Gang, der an seinem bergseitigen Ende in einen rechteckigen Raum mündet (sogenannter Keller), von dem aus man wieder durch einen breiten Durchgang nach draußen gelangt. Von dem Gang aus zweigen außerdem zwei annähernd quadratische Seitenkammern ab. Im Felsen oberhalb dieser Anlage befinden sich noch vier unregelmäßige, nach außen offene Felsnischen bzw. Kleinhöhlen.
Der mittlere Teil liegt etwas höher und ist durch eine Treppe zu erreichen. Er besteht aus mehr oder weniger tiefen Nischen, sowie zwei nach außen hin offenen Felsräumen, die durch einen Türdurchgang verbunden sind (sogenannte Küche). Der nördlichste Raum (Hafnerhöhle) ist ebenfalls nach außen offen.

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